环境与生物工程学院设有环境工程系、生物工程系、化学工程系、食品工程系、基础化学部和实践教学中心等6个教学单位；学院具备从本科到硕士的人才培养体系，开设环境工程、生物技术、应用化学和食品质量与安全等4个本科专业，在校本科生1000多人；具有资源与环境硕士专业学位授权点，主要培养环境工程领域硕士研究生；教学科研条件较完善，实验室面积约5775㎡，仪器设备总值约4000余万元。
学院拥有一支优秀的师资队伍，现有专任教师51位，其中教授11人，副教授24人，高级工程师2人，博士30人，硕士14人，硕士生导师42人；国务院特殊津贴专家1人，省级高层次人才4人，福建省高校新世纪优秀人才支持计划3人，福建省高校杰出青年科研人才计划4人，壶兰学者1人，莆田市第一批特殊支持高层次人才1人，莆田市科技创新领军人才1人，莆田市青年拔尖人才2人；已形成一支称职、学历、年龄及学缘结构合理，科研能力强、教学水平高的师资队伍。
学院拥有良好的人才培养平台，建有“环境工程”和“生物技术”两个福建省一流本科专业建设点、“环境工程”福建省本科高校专业综合改革试点、“应用化学”福建省高校服务地方产业特色专业、生物化工技术省级虚拟仿真试验教学中心、生物学省级实验教学示范中心、基础化学省级公共基础课实验教学平台、应用化学省级教学实验平台、校企合作共建应用化学专业省级大学生校外实践教育基地、福建省应用化学人才培养模式创新实验区等10个省级教学平台；建有“生物与医药”专业硕士学位培育点、应用化学实验教学示范中心、环境工程实验教学示范中心、环境工程卓越人才培养试点、生物技术卓越人才培养试点、应用化学卓越人才培养试点等6个校级教学平台；质量工程建设取得新成效，建有1个生物技术省级教学团队，建有省级“课程思政”课程1门、省级精品在线开放课程1门、省级一流课程8门。
学院拥有先进的科学研究平台，建有“生物工程”和生态环境”两个省级重点学科、“环境科学与工程”省级应用型学科、福建省新型污染物生态毒理效应与控制重点实验室、福建省高校生态环境及其信息图谱重点实验室等5个省级学科平台；建有莆田学院环境科学与技术研究所、莆田学院海洋牧场与海岸带生态环境协同创新中心、莆田学院特色生物资源产业化工程协同创新中心等3个校级科研平台。
近年来，学院成功先后承办近10场省级以上学术会议；新立项各类科研项目96项，经费共1100多万元，其中国家自然科学基金项目5项，福建省区域重大项目2项，省部级重点项目9项；获包含福建省科学技术奖三等奖在内的省市级科研成果奖19项；发表论文SCI收录123篇、EI收录62篇，授权发明专利30余项。
环境与生物工程学院正按照莆田学院确立的“应用型、地方性、开放式、特色化”的办学定位和“以应用为原则，以行业为依托，以专业为基础，整合资源，形成团队，产学协作，项目推动”的学科建设思路，以建设特色鲜明的应用型大学的目标而努力。