1、前处理:破碎和抽提，并把抽提液和细胞碎片分离开。
2、粗分级分离:将目标蛋白与细胞其它成分分离开，还可以使用超滤、冷冻干燥等方法进行。
3、细分级分离:使用凝胶过滤、离子交换层析、吸附电泳的方法进行分离。
4、结晶:是蛋白质纯化的高级阶段蛋白纯度越高就越容易结晶，是应用XRD检测的前提力指标。
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