习近平总书记在党的十八大以来的一系列重要讲话中，提出了“全面深化改革”的重要思想。具有极其丰富的内容，其主要特点表现在6个方面：
1，进入攻坚期和深水区的改革思想。
要学习领会习近平总书记的全面深化改革思想，首先要看到，这是在我国全面建成小康社会的历史进程中，改革进入攻坚期和深水区这一关键时刻提出的中国改革思想。也就是“啃硬骨头”和“涉险滩”的改革。这里，“攻坚期”和“深水区”、“啃硬骨头”和“涉险滩”，既是习近平总书记领导改革开放的背景，也是全面深化改革思想的特点。
2.以经济体制改革为重点的各项改革协同配合推进的全面改革思想
习近平总书记关于推进改革开放的一系列重要举措及其提出的重要论述，既继承了历届党中央的改革思想，又具有新一届党中央的鲜明特色。其最大的特色，就是强调“全面深化改革”。 习近平总书记的思想是，改革开放是一场深刻而全面的社会变革，每一项改革都会对其他改革产生重要影响，每一项改革又都需要其他改革协同配合。因此，他提出，改革开放是一个系统工程，必须坚持全面改革，在各项改革协同配合中推进。也就是说，“全面改革”不是线性推进的全面改革，而是各项改革协同配合推进的系统工程。这是一个非常深刻的思想。 与此同时，我们也要注意到，习近平总书记所说的“全面深化改革”是有重点的全面改革。这个重点，就是经济体制改革。习近平总书记强调，经济体制改革仍然是全面深化改革的重点，经济体制改革的核心问题仍然是处理好政府和市场关系。我们要建立的经济体制，是社会主义市场经济体制。从提出这一改革的目标之日起，就碰到一个大问题，这就是政府有什么作为，市场有什么作为，怎么处理好政府与市场的关系。
3.“摸着石头过河”与“加强顶层设计”辩证统一的改革思想
习近平总书记一再指出，改革开放是前无古人的崭新事业，必须坚持正确的方法论，在不断实践探索中推进。他所说的“改革方法论”，就是要把“摸着石头过河”与“加强顶层设计”结合起来的方法。 习近平总书记指出，摸着石头过河，是富有中国特色、符合中国国情的改革方法。摸着石头过河就是摸规律，从实践中获得真知。摸着石头过河和加强顶层设计是辩证统一的，推进局部的阶段性改革开放要在加强顶层设计的前提下进行，加强顶层设计要在推进局部的阶段性改革开放的基础上来谋划。为此，在领导改革的过程中，我们既要加强宏观思考和顶层设计，更加注重改革的系统性、整体性、协同性，同时也要继续鼓励大胆试验、大胆突破，不断把改革开放引向深入。比如，中央决定在上海建自由贸易试验区，“试验”就是“摸着石头过河”，同时它也是宏观的顶层设计的产物。 之所以要强调这一点，是因为认识来自实践，对策来自问题。
4.按照内在规律领导中国改革的思想
“摸着石头过河”与“加强顶层设计”相结合的改革方法论,是为了探索中国改革的内在规律。2013年，习近平总书记在湖北调研时指出，应对当前我国发展面临的一系列矛盾和挑战，关键在于全面深化改革。必须从纷繁复杂的事物表象中把准改革脉搏，把握全面深化改革的内在规律，特别是要把握全面深化改革的重大关系，处理好解放思想和实事求是的关系、整体推进和重点突破的关系、顶层设计和摸着石头过河的关系、胆子要大和步子要稳的关系、改革发展稳定的关系。 事实就是这样。我国改革开放经过多年快速发展，在增长方式和发展方式上的问题越来越突出。党的十七大明确提出，促进经济增长由主要依靠投资、出口拉动向依靠消费、投资、出口协调拉动转变，由主要依靠第二产业带动向依靠第一、第二、第三产业协同带动转变，由主要依靠增加物质资源消耗向主要依靠科技进步、劳动者素质提高、管理创新转变。这些思路是正确的。问题是，怎么样按照科学发展观的要求，调整经济结构，加快转变经济发展方式。这些问题也引起了我们思考。思考的结果是，要发展就要改革，要全面协调可持续发展就要全面深化改革；中国不仅要改革，还要各项改革相互配套、协同推进的全面改革，光靠单项改革也无法解决这些盘根错节、错综复杂的问题。因此，要深入研究中国改革的内在规律，按照改革的规律来全面深化改革。
5.始终坚持正确方向的改革思想
习近平总书记重视改革的规律性问题，同他坚持的改革的正确方向是直接相联系的。他反复强调，改革开放是一场深刻革命，必须坚持正确方向，沿着正确道路推进。在方向问题上，我们头脑必须十分清醒，不断推动社会主义制度自我完善和发展，坚定不移走中国特色社会主义道路。 他还明确指出，中国是一个大国，决不能在根本性问题上出现颠覆性错误，一旦出现就无法挽回、无法弥补。我们的立场是胆子要大、步子要稳，既要大胆探索、勇于开拓，也要稳妥审慎、三思而后行。我们要坚持改革开放正确方向，敢于啃硬骨头，敢于涉险滩，敢于向积存多年的顽瘴痼疾开刀，切实做到改革不停顿、开放不止步。 与此同时，习近平总书记指出，改革开放是亿万人民自己的事业，必须坚持尊重人民首创精神，坚持在党的领导下推进。
6.以完善和发展中国特色社会主义制度，推进国家治理体系和治理能力现代化为目标的改革思想
党的十八届三中全会提出，全面深化改革的总目标是完善和发展中国特色社会主义制度，推进国家治理体系和治理能力现代化。对于这个总目标，要有一个科学的认识。一要正确认识和处理好“完善和发展中国特色社会主义制度”和“推进国家治理体系和治理能力现代化”之间的关系。在以全新的、现代的“治理”理论来推进国家治理体系和治理能力现代化时，不能偏离中国特色社会主义方向；在完善和发展中国特色社会主义制度时，要以推进国家治理体系和治理能力现代化这样的要求来完善和发展我们的制度。二要正确认识和处理好“国家治理体系现代化”和“治理能力现代化”之间的关系。改革是制度的变革，治理体系与国家制度相联系，这是毫无疑问的。但是，如果只有制度的变革，而没有能力的提升，制度的完善和发展、治理体系的现代化都有可能成为一纸空文，所以，我们要把国家治理体系的现代化与国家治理能力的现代化统一起来推进。三要正确认识和处理好“国家治理体系和治理能力现代化”与“培育和践行社会主义核心价值观”之间的关系。国家治理体系的现代化特别是治理能力的现代化，与全社会奉行什么样的核心价值观紧密相联系。因为，“治理”与“管理”虽然仅有一字之差，但却是两种不同的国家领导方式和执政方式。简单地说，管理主要是用行政的办法自上而下领导一个国家和社会，治理则根据社会多元化的特点，采用民主和法治的方式自下而上与自上而下结合起来领导一个国家和社会。这就更需要在核心价值观上达成共识。